• 1. 이사장 : 1인
• 2. 원 장 : 1인
• 3. 부원장 : 5인 이내(수석부원장 1인 포함) 〈개정 2016.3.22〉
• 4. 이 사 : 20인 이내로 한다(이사장과 원장, 수석부원장을 제외한다)〈개정 2008.6.12., 2016.3.22〉
• 5. 감 사 : 2인

제15조 [임원의 선임과 임기] ① 이사장은 의학교육계의 원로 중에서 이사장후보추천위원회의 추천을 받아 이사회에서 선출한다.〈신설 2017.3.10.〉
② 이사장은 재적이사 3분의 2 이상의 찬성으로 선출하고, 임기는 3년이며 연임할 수 있다.〈개정 2017.3.10.〉
③ 이사장이 궐위되었을 때에는 지체 없이 후임 이사장을 선출하여야 한다.〈신설 2017.3.10.〉
④ 이사장후보추천위원회는 이사장 후보자의 모집과 심사, 추천 등의 업무를 수행한다.〈신설 2017.3.10.〉
⑤ 이사장후보추천위원회의 구성과 운영 등에 관한 사항은 별도로 정한다.〈신설 2017.3.10.〉

제16조 [원장, 부원장의 선임과 임기] ① 원장은 의학교육과 평가인증에 대한 지식과 경험이 있는 전문가로 이사회에서 재적이사 과반수의 찬성으로 선출하고, 임기는 3년이며 연임할 수 있다.〈개정 2017.3.10.〉
② 부원장은 원장이 추천하고, 이사회에서 의결한다. 수석부원장 1인은 당연직 이사로 한다. 〈개정 2016.3.22〉
③ 원장이 궐위된 때에는 수석부원장이 그 업무를 대행한다.〈개정 2016.3.22.〉
④ 원장 후보자 모집과 자격요건 등에 관한 사항은 별도로 정한다.〈신설 2023.9.27.〉

제17조 [이사, 감사의 선임과 임기] ① 이사는 당연직 이사와 정부대표(보건복지부장관 및 교육부장관이 추천하는 자), 공익대표(교육계, 언론계, 법조계 각 1인)를 포함한다.〈개정 2017.3.10.〉
② 당연직 이사는 다음 각 호에 따라 구성한다.〈개정 2017.3.10.〉

• 1. 대한의사협회장과 대한의사협회장이 추천하는 자 5인
• 2. 대한병원협회장과 대한병원협회장이 추천하는 자 1인〈개정 2005.1.19.〉
• 3. 대한의학회장과 대한의학회장이 추천하는 자 1인
• 4. 한국의과대학․의학전문대학원협회 이사장과 한국의과대학․의학전문대학원협회 이사장이 추천하는 자 1인〈개정 2017.3.10.〉
• 5. 한국보건의료인국가시험원장
• 6. 한국의학교육협의회장이 추천하는 자 1인〈개정 2005.1.19.〉
• 7. 한국의학교육학회장
• 8. 의평원 원장과 수석부원장〈신설 2017.3.10.〉

③ 의평원의 목적 사업을 전담하기 위하여 상임이사를 둘 수 있으며, 상임이사는 이사장이 이사회의 의결을 거쳐 이사 중에서 선임한다.
④ 감사는 이사회에서 재적이사 과반수의 찬성으로 선임한다.〈개정 2017.3.10.〉
⑤ 이사와 감사가 임기 중에 궐위된 때에는 궐위된 날부터 2개월 이내에 선임하고, 임기가 만료되는 때에는 임기 만료 1개월 이전에 선임하여야 한다.〈개정 2017.3.10.〉
⑥ 이사와 감사의 임기는 3년이며 연임할 수 있다. 다만 당연직 이사의 임기는 당해 직책의 재임기간(이사장은 예외로 한다)으로 하고, 보선된 임원의 임기는 전임자의 잔여 임기로 한다.〈개정 2017.3.10.〉

제18조 [임원의 해임] 다음 각 호의 1에 해당하는 경우에는 이사회에서 재적 이사 3분의 2 이상의 의결로 임원을 해임할 수 있다.

• 1. 정관 또는 규정에 위반하여 의평원의 명예를 훼손하였을 때
• 2. 고의 또는 과실로 의평원에 중대한 손실을 초래하였을 때
• 3. 기타 사유로 인하여 그 업무를 수행할 수 없는 때

제19조 [임원의 직무] ① 이사장은 이사회를 소집하고 그 의장이 된다.
② 원장은 의평원을 대표하며, 업무를 통할한다.〈신설 2017.3.10.〉
③ 이사는 이사회에 출석하여 의평원의 업무에 관한 사항을 심의․의결한다.
④ 감사는 다음 각 호의 직무를 수행한다.〈신설 2017.3.10.〉

• 1. 의평원의 재산 상황의 감사
• 2. 의평원의 운영과 그 업무에 관한 사항의 조사
• 3. 위 제1호와 제2호의 사항에 대하여 이사회에 보고〈개정 2017.3.10.〉
• 4. 이사회에 출석하여 의견 개진